化学与药物信息检索
站点收录化学物质属性信息,并同时支撑药物信息门户(Drug Information Portal),可供查询化学名称、标识符、分子式等检索入口。
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美国国家医学图书馆的化学物质与药物信息检索库,2022 年 12 月起内容仅从 PubChem 获取
ChemiDplus 由美国国家医学图书馆(NLM)运营,是一个汇集化学物质与药物属性信息的检索站点,其数据同时也被药物信息门户 Drug Information Portal 复用。2022 年 12 月 12 日起,NLM 将 PubChem 作为化学信息的唯一来源,ChemiDplus 与 Drug Information Portal 正式退役,原有数据全部并入 PubChem 继续提供,ChemiDplus 数据还可通过 NLM Data Distribution Program 以批量文件下载。站点本身已不再更新新内容,2022 年 11 月 1 日之后不再新增内容,退役后的数据复核结果在 2023 年 2 月 28 日前用于更新 PubChem。对需要历史检索界面的用户来说,这已不是首选入口。
ChemiDplus 是美国国家医学图书馆(NLM)推出的化学物质与药物信息检索站点,收录化学属性信息,并把这些数据同时提供给药物信息门户(Drug Information Portal)使用。它面向需要查询化学物质标识、分子式等信息的科研人员、学生与工业界用户。
按照 NLM 的公告,2022 年 12 月 12 日起 PubChem 成为 NLM 化学信息的唯一来源,ChemiDplus 与 Drug Information Portal 两个站点被退役,以便把开发力量集中到单一集成信息源上。ChemiDplus 与 Drug Information Portal 中原本能找到的数据,目前以及此后都继续在 PubChem 中提供。站点在 2022 年 11 月 1 日之前仍在陆续加入新内容,之后不再新增,两站保留至 2022 年 12 月中旬退役。
不同用户的使用方式因此发生分化:普通检索者应直接转向 PubChem,借助官方指南在 PubChem 中查找原 ChemiDplus 内容;需要批量数据的用户可以通过 NLM Data Distribution Program 下载 ChemiDplus 数据文件,并借助 REST、SOAP API 等程序化接口访问 PubChem 数据;教学场景则可使用 NLM 提供的自定进度 PubChem 教程,按化学名称、标识符、分子式、基因符号、蛋白质、通路、分类与结构逐步检索。
站点收录化学物质属性信息,并同时支撑药物信息门户(Drug Information Portal),可供查询化学名称、标识符、分子式等检索入口。
ChemiDplus 数据(含 Drug Information Portal 的全部数据)可通过 NLM Data Distribution Program 以批量下载文件的形式获取,两站退役后该渠道继续提供。
2022 年 12 月 12 日起 PubChem 作为 NLM 化学信息的唯一来源,原 ChemiDplus 数据在 PubChem 中继续可用,并有官方迁移指南说明如何在 PubChem 中找到这些内容。
PubChem 提供 REST 与 SOAP API,可程序化访问其数据,适合把化学信息批量接入自有系统或分析流程。
NLM 提供自定进度的 PubChem 教程,分步演示如何用化学名称、标识符、分子式、基因符号、蛋白质、通路、分类与结构查找化学信息。
PubChem 汇聚了数百个学术、政府与工业来源贡献的化学属性与结构数据,规模上自称全球最大的免费化学信息集合。
当成新工具来用,ChemiDplus 已经不合适——站点在 2022 年 12 月中旬退役,2022 年 11 月 1 日之后不再新增内容,检索请直接用 PubChem。但如果你要的是历史数据资产,它仍有用:ChemiDplus 数据可通过 NLM Data Distribution Program 批量下载,退役后 NLM 还会做一次最终数据复核,结果在 2023 年 2 月 28 日前用于更新 PubChem,同时旧的 ChemID 文件会从数据分发站点移除。
需要按化学名称、标识符或分子式查询化合物属性的研究场景,退役后应改用 PubChem,仍能找到原 ChemiDplus 数据。
需要整批化学属性数据做建模或清洗,可用 NLM Data Distribution Program 下载 ChemiDplus 批量文件,或用 PubChem 的 REST、SOAP API 拉取。
可直接使用 NLM 的自定进度 PubChem 教程,覆盖名称、标识符、分子式、基因符号、蛋白质、通路、分类与结构等检索方式,适合课堂演示。
ChemiDplus 自 2022 年 11 月 1 日后不再新增内容,站点已退役。要求数据持续更新的项目不应把它作为主数据源。
本站点已退役且链接可能失效,直接使用 PubChem 检索更省事,无需先经过已归档的 ChemiDplus 页面。
站点已被 NLM 退役:ChemiDplus 与 Drug Information Portal 保留到 2022 年 12 月中旬,2022 年 12 月 12 日起 PubChem 成为 NLM 化学信息的唯一来源。页面本身是归档内容,链接可能已随时间失效,继续做检索应转向 PubChem。
ChemiDplus 与 Drug Information Portal 中的数据仍在 PubChem 中提供,官方还发布了在 PubChem 中查找 ChemiDplus 内容的快速指南。此外整套数据可通过 NLM Data Distribution Program 以批量文件下载,站点退役后该渠道继续提供。
2022 年 12 月 12 日起,PubChem 成为 NLM 化学信息的唯一来源,NLM 退役 ChemiDplus 和 Drug Information Portal,是为了把开发力量集中到这一单一集成信息源上。原有两站的数据在 PubChem 中继续可用,PubChem 是承接方。
站点在 2022 年 11 月 1 日之前仍在加入新内容,之后不再新增。站点退役后,NLM 员工会对数据做最终复核,最终 ChemID 数据集用于更新 PubChem 并发布到 NLM Data Distribution 站点,这些更新在 2023 年 2 月 28 日前完成。
可以。PubChem 的 Programmatic Access 部分说明了数据的程序化访问方式,包括 REST 与 SOAP API 特性,适合把化学属性或结构数据接入自有系统与分析流程。
NLM 提供了一份自定进度的 PubChem 教程,逐步演示如何用化学名称、标识符、分子式、基因符号、蛋白质、通路、分类与结构来查找化学信息,也覆盖了如何访问数百个学术、政府与工业来源贡献到 PubChem 的化学属性与结构数据。
| 工具 | 编辑评分 | 价格 | 核心功能 | 平台 |
|---|---|---|---|---|
| ChemiDplus本工具 | 4.2 | 未标价 | 化学与药物信息检索;批量数据下载;数据并入 PubChem;程序化访问 | Web |
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