藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能

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藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能。当用户提供含药血清/组织峰表、空白对照数据或MS/MS谱图,要求"鉴定入血成分""区分原型与代谢物""分析血清药物化学""血清药物化学""入血成分分析""UHPLC-Q-TOF-MS/MS代谢物鉴定"时触发。面向藏药/民族药/中药的血清药物化学研究、药效物质基础研究、新药发现、PK/PD研究的入血成分确证场景。基于五步过滤法(去内源→定原型→追代谢→归异构→结构化报告),在内源性干扰下精准鉴定机体暴露化学物质。

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藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能是效率类的 Agent Skill,安装方式未标注,权限级别未标注,许可证不明确,有可直接复制的安装命令。技能本质是给模型读的说明书,效果取决于模型与客户端;装完先用一个小任务验证,再放进正式流程。

分类效率 安装方式未标注 权限级别未标注权限 许可证许可证不明确
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安装

未标注
在支持 Skills 的客户端里执行,装完问一句「你有哪些技能」验证
skillhub install user_c160f2b7/tibetan-serum-pharm-chem
  1. 1
    确认客户端支持

    确认你的客户端支持 Skills(Claude、Codex、Cursor 等),并升级到较新的版本。

  2. 2
    拿到技能文件

    执行上面的命令安装;也可以把仓库里的 SKILL.md 手动放进客户端的 skills 目录。

  3. 3
    刷新技能列表

    重新打开客户端,或刷新技能列表,让新放进来的技能被加载。

  4. 4
    验证是否生效

    问一句「你有哪些技能」,确认列表里出现它,再拿一个小任务试跑。

技能档案

效率
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作者 / 维护方user_c160f2b7仓库 未标注 · 版本 未标注
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安装方式未标注安装包 community
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典型使用场景

3 类
按分类整理的常见用法,具体以 SKILL.md 为准
整理待办与日程

把零散任务收进清单,排出优先级。

批量处理重复任务

把固定动作做成模板,重复执行。

把流程写成清单

把口头流程整理成可复用的步骤。

选择建议

装之前先看这几条
按条目字段给出的判断,不替你决定用不用

值得选的地方

  • 有可直接复制的安装命令,不用自己翻文档找入口。

先想清楚的地方

  • 没有标注权限级别,实际能做什么要装好后确认。
  • 许可证不明确,商用或二次分发前先到仓库确认条款。
  • 没有做站内核验,内容以作者仓库为准。
  • 技能只是说明书,实际效果取决于模型与客户端,装完先用小任务试一遍。

更适合

  • 需要在效率场景里给模型补一套做法的人。
  • 愿意先读一遍 SKILL.md、确认它会让模型做什么的人。

不太适合

  • 对许可证要求很严、必须明确可商用的人。
  • 只想装完就自动变强、不打算看说明书的人。

同类对比

6 个同类
同分类里挑最接近的几条,字段以各自详情页为准
技能权限级别安装方式累计安装宿主客户端安装命令
藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能当前 未标注权限 未标注 未标注 未标注 有
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藏药血清药物化学与 UHPLC-Q-TOF-MS/MS 入血成分深度解析

概述

本技能面向藏药/民族药/中药的血清药物化学研究,专精于基于 UHPLC-Q-TOF-MS/MS 技术的复杂生物基质(大鼠血清/组织)分析。核心任务是在复杂的内源性干扰背景下,精准鉴定灌胃后机体暴露的化学物质,并对原型成分与代谢产物进行逻辑严密的归因区分。

工作流概览

采用五步过滤法进行逻辑推演:

原始数据(峰表/MS/MS图谱)
        │
        ▼
第一步:数据质控与内源性干扰排除(去伪存真)
   ├── 背景扣除(对照空白血清/组织 BPC/XIC)
   └── 同位素峰型校验(<5 ppm)
        │
        ▼
第二步:原型成分鉴定(回溯母药)
   ├── 数据库匹配(藏药专属化学成分库)
   └── tR + 加合峰 + ≥3 特征诊断碎片 == 原型成分
        │
        ▼
第三步:代谢产物智能预测与锁定(代谢物捕获)
   ├── I相反应(氧化/还原/水解/脱烷基)
   └── II相结合反应(葡萄糖醛酸/硫酸/谷胱甘肽/甲基化)
        │
        ▼
第四步:原型 vs 代谢物的严格区分(核心判定)
   ├── 判据A(分子量变化)
   ├── 判据B(MS/MS同源性)
   └── 判据C(时间窗口)
        │
        ▼
第五步:结构化报告输出(Markdown表格+质谱证据)

详细操作方法

第一步:数据质控与内源性干扰排除(去伪存真)

  1. 背景扣除:必须对照空白血清/组织(灌胃溶媒组)的基峰色谱图(BPC)和提取离子流图(XIC)。剔除在空白组中响应强度 ≥ 含药组响应强度 1/3 的离子。
    - 例如:若含药组某峰强度为 3.0e5,空白组对应 tR 窗口内强度 ≥ 1.0e5,则标记为内源性干扰并剔除。
    - 例外规则:若某离子在空白组和含药组中均有检出,但其在含药组的 MS/MS 谱图中出现空白组不存在的特征碎片,则不应直接剔除,应保留至第二步进一步验证。

  2. 同位素峰型校验:检查候选离子的同位素分布(如含 Cl 元素的 ( ^{37}\text{Cl} ) 特征峰型 M:M+2 ≈ 3:1,含 S 的 ( ^{34}\text{S} ) M:M+2 ≈ 24:1,含 Br 的 M:M+2 ≈ 1:1),确认其分子式推测的合理性。
    - 质量数误差须 < 5 ppm(对含药成分应尽量严控 < 3 ppm)。
    - 含矿物药特殊处理:若图谱中出现含 Hg(M:M+2 复杂多重峰型)、Au(单一同位素丰度异常)等异常同位素峰型的离子,参照本技能特殊约束部分另行处理。

  3. 信噪比筛选:剔除信噪比(S/N)< 10 的弱信号峰,避免低置信度归属。

第二步:原型成分鉴定(回溯母药)

  1. 数据库匹配:基于精确质量数(m/z)和二级碎片(MS/MS)的匹配度,检索藏药专属化学成分库(见 references/tibetan-chem-classes.md),涵盖以下藏药常见类别:
    - 生物碱类:乌头碱型/次乌头碱型、小檗碱型、吲哚类生物碱等
    - 黄酮及其苷类:山奈酚苷、槲皮素苷、异鼠李素苷、木犀草素苷等
    - 萜类:环烯醚萜苷(栀子苷类)、三萜(齐墩果酸/熊果酸)、二萜等
    - 蒽醌类:大黄素、大黄酸、大黄酚、大黄素甲醚等
    - 苯乙醇苷类:acteoside/verbascoside、echinacoside 等
    - 苯丙素类:绿原酸、阿魏酸、香豆素类
    - 鞣质/多酚类:没食子酸、鞣花酸、原花青素类

  2. 确认标准:当且仅当候选离子的以下三项参数全部满足时,定性为 "原型成分(母体)":
    - 保留时间(tR) 与对照品或文献数据一致(偏差通常 < 0.2 min)
    - 一级质谱加合峰形式([M+H]⁺, [M-H]⁻, [M+Na]⁺, [M+HCOO]⁻ 等)符合目标化合物的电离特性
    - 至少 3 个特征诊断碎片离子与对照品或文献报道高度一致

  3. 碎片诊断参考:对于特征碎片归属的判定,查阅 references/tibetan-chem-classes.md 中各类化合物的裂解规律。

第三步:代谢产物智能预测与锁定(代谢物捕获)

基于鉴定出的母体结构,系统预测其在体内的常见生物转化途径,搜寻色谱图中存在的代谢物候选峰。

  1. I 相反应(常见质量偏移):
    | 反应类型 | 质量偏移 (Da) | 说明 |
    |:---|:---:|:---|
    | 羟基化(单氧化) | +15.9949 | 最常见 I 相代谢,CH→COH |
    | 环氧化 | +15.9949 | 难与羟基化区分,需碎片确认 |
    | 双氧化 | +31.9898 | 二羟基化或亚砜形成 |
    | 还原 | +2.0157 | C=C→C-C,C=O→CHOH |
    | 水解 | +18.0106 | 酯/酰胺键水解开环 |
    | N-脱烷基(脱甲基) | -14.0157 | N-CH₃→N-H |
    | O-脱烷基(脱甲基) | -14.0157 | O-CH₃→O-H |
    | 脱糖基 | -162.0528 | 失去葡萄糖基(已糖) |
    | 脱糖基(去氧糖) | -146.0579 | 失去去氧己糖基 |
    | 脱糖醛酸 | -176.0321 | 失去葡萄糖醛酸基 |
    | 脱氢 | -2.0157 | 形成 C=C 双键 |

  2. II 相结合反应(常见质量偏移):
    | 反应类型 | 质量偏移 (Da) | 诊断碎片/中性丢失 |
    |:---|:---:|:---|
    | 葡萄糖醛酸化 | +176.0321 | MS² 中性丢失 176.0321 (C₆H₈O₆) |
    | 硫酸化 | +79.9568 | MS² 丢失 79.9568 (SO₃) 或出现 m/z 96.9596 [HSO₄]⁻ |
    | 谷胱甘肽结合 | +305.0682 | MS² 特征丢失 129.0426 (焦谷氨酸) |
    | 甲基化 | +14.0157 | 常见于儿茶酚-O-甲基转移酶 |
    | 乙酰化 | +42.0106 | 常见于胺基/酚羟基 |
    | 甘氨酸结合 | +57.0215 | 常见于羧酸类 |
    | 牛磺酸结合 | +107.0041 | 常见于胆汁酸类 |
    | 半胱氨酸结合 | +119.0041 | 谷胱甘肽降解产物 |

  3. 代谢物捕捉规则:
    - 允许保留时间有适度漂移(极性改变——通常极性增大则 tR 减小,极性减小则 tR 增大)
    - 必须具有母核特征碎片离子(特征性中性丢失),即代谢物 MS/MS 中需保留母体的核心骨架碎片
    - 质荷比变化可通过精确质量数计算确认

第四步:原型 vs 代谢物的严格区分(核心判定逻辑)

在面对一个待鉴定离子时,依据以下决策树强制输出结论:

待鉴定离子
    │
    ├── 判据A:分子量比所有已知母体大出结合基团质量(如+176.0321)
    │   或小出脱烷基质量(如-14.0157),且缺乏母体完整分子离子峰响应?
    │   ├── 是 → 判为&quot;代谢物&quot;
    │   └── 否 → 判据B
    │
    ├── 判据B:MS/MS 碎片
    │   ├── 包含母体核心骨架碎片 → 判为&quot;代谢物&quot;
    │   ├── 碎片完全不同,无法匹配母体裂解规律
    │   │   ├── 分子量对应 → 判为&quot;外源性干扰物/假阳性&quot;
    │   │   └── 分子量不对应 → 判为&quot;未知新化合物&quot;
    │   └── 碎片部分重合但差异较大 → 判据C
    │
    └── 判据C:时间窗口
        ├── 与母体原型峰完全一致(共洗脱)
        │   ├── MS/MS 高度重合 → 排除为源内裂解(In-source CID)碎片
        │   └── MS/MS 有差异 → 进一步分析
        └── 与母体 tR 不同 → 参照判据A+B综合判定

判定细则:

  1. 判据A(分子量变化):
    - 若精确质量数比所有已知母体均大出结合基团(如 +176.0321、+79.9568、+305.0682)或小出脱烷基质量(如 -14.0157),且缺乏母体完整的分子离子峰响应,判为 "代谢物"。
    - 若分子量变化落于上述质量偏移列表之外,先核实是否为内源性干扰或加合离子,再考虑不常见代谢途径。

  2. 判据B(MS/MS 同源性):
    - 若该离子产生的二级碎片中,包含母体化合物的核心骨架碎片(如黄酮类的 Retro-Diels-Alder [RDA] 碎片、生物碱的特征性中性丢失),判为 "代谢物"。
    - 若碎片完全不同,且无法匹配母体裂解规律,即使分子量对应,也应判为 "外源性干扰物/假阳性" 或 "未知新化合物"。

  3. 判据C(时间窗口):
    - 若该峰与母体原型峰的出峰时间完全一致(共洗脱),且 MS/MS 高度重合,即使分子式略有差异,需慎重排除仪器源内裂解(In-source CID)产生的碎片离子。
    - 源内裂解判别方法:改变离子源锥孔电压/fragmentor 电压,若碎片离子比例随之显著变化,则极可能为 In-source CID 产物而非体内代谢物。若无条件改变电压,则按下述规则判断——若 MS/MS 几乎与母体一致且无特征代谢修饰中性丢失,优先判为 "源内裂解碎片" 而非代谢物。

第五步:结构化报告输出

将最终鉴定结果按以下 Markdown 表格格式输出,在表后附上关键的质谱裂解证据说明。

输出表格格式:

编号 分子式 加合形式 实测 m/z 误差 (ppm) tR (min) 鉴定结果 归属类型 代谢途径(如适用) 置信度
1 C₂₁H₂₂O₉ [M-H]⁻ 417.1192 1.2 12.34 山奈酚-3-O-葡萄糖苷 原型成分 — 高
2 C₂₇H₃₀O₁₆ [M-H]⁻ 609.1456 -0.8 9.87 山奈酚-3-O-葡萄糖苷-葡萄糖醛酸结合物 II相代谢物 葡萄糖醛酸化 中

置信度分级:
- 高:tR + 精确质量数 (< 3 ppm) + ≥ 3 个特征碎片全部匹配对照品
- 中:精确质量数匹配 + 有特征碎片 + 裂解规律合理,但无对照品
- 低:仅精确质量数匹配,碎片信息不充分


特别约束与术语规范

1. 严禁混淆代谢物与人工产物

绝对禁止将以下情况归类为机体代谢产物:
- 源内裂解(In-source CID)产生的碎片峰——源内裂解发生在离子源中,非体内生物酶催化过程
- 柱上降解产物——分析过程中的化学降解
- 样品制备过程中产生的氧化/水解产物

代谢物必须是体内生物酶催化的产物。

2. 藏药背景强规则

鉴于藏药多含重金属和特殊矿物药(如佐太、朱砂、寒水石等),如果 MS 图谱中出现含 Hg、Au、Ag、Cu、Fe 等异常同位素峰型的离子,请单独标注为 "矿物药相关离子/加合物",不归入有机入血成分。

处理步骤:
1. 计算同位素峰型看是否匹配目标元素理论丰度
2. 若确认含重元素,标注为矿物药相关
3. 在报告中单独列出,不参与原型/代谢物判定

3. 未知峰处理

对于响应强但无法匹配任何母体裂解规律的高质量精度峰,标注为 "未知显著移行成分(需进一步 MS³ 或 NMR 确证)",严禁强行归属。

4. 术语规范

  • 背景扣除 —— 通过扣除对照样品信号去掉内源性干扰
  • 同位素峰型 —— 元素的天然同位素丰度分布
  • 特征诊断碎片 —— 可用于唯一鉴定某类/某个化合物的特异性碎片离子
  • 共洗脱 —— 两个及以上组分在同一时间点被洗脱出柱

参考资源

本技能配备以下参考文件(位于 references/ 目录),可依据需要加载:

文件 内容 何时加载
tibetan-chem-classes.md 藏药化学成分类别、MS/MS 裂解规律、诊断碎片表 第二步原型鉴定 & 第三步代谢追踪
metabolism-rules.md 详细 I/II 相代谢反应表、质量偏移、MS/MS 诊断特征 第三步代谢物预测
mineral-isotopes.md 藏药常见矿物药元素同位素丰度表、含矿物药 MS 图谱判读指导 第一步内源性排除 & 特别约束

启动指令

当用户请求启动此技能时,回复以下启动语:

"已加载藏药血清药物化学 UHPLC-Q-TOF-MS/MS 分析技能。请上传您的样本数据(含药血清/组织峰表、空白对照数据及 MS/MS 谱图),我将严格遵循'去内源-定原型-追代谢-归异构'的法则,为您区分入血的原型成分与代谢产物。"

常见问题

5 问
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藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能怎么安装?

在支持 Skills 的客户端里执行:skillhub install user_c160f2b7/tibetan-serum-pharm-chem。安装方式为未标注。装完刷新技能列表或重开客户端。

藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能支持哪些客户端?

资料没有标注宿主客户端,但只要客户端支持 Skills(Claude、Codex、Cursor 等),一般都能加载。

藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能权限高吗,安全吗?

权限级别为未标注权限。安装前先看它会读取或写入哪些内容。

藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能收费吗?

本站不代收费用,也没有标注具体价格。是否收费取决于技能本身和所用的模型或客户端,正式使用前按作者说明确认。

藏药血清药物化学与UHPLC-Q-TOF-MS/MS入血成分深度分析技能用什么许可证?

许可证标注为 未说明(许可证不明确)。商用或二次分发前请到仓库确认条款原文。

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